1. 投资主体不同：
一人有限责任公司投资主体可以是自然人，也可以是法人。法人是相对于自然人而存在的，我们每个人都是自然人，法人是具有民事权利能力和民事行为能力的自然人，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织或个人，是社会组织在法律上的人性化。一人有限公司，可能并不是一个自然人，也可以是法人组织。而个人独资企业的投资主体只有一个人，就是自然人。责任由自己独资承担。
2.法律形式不同：
一人有限责任公司属于法定民事主体，具有法人资格，个人独资企业不具有。原因就是个人独资企业主体是自然人，自然人不具有承担民事责任和享受民事权利的资格。
3. 设立条件不同：
一人有限责任公司注册资本最低额度是人民币10万元，股东一次性缴纳公司规定出资额。个人独资公司的设立没有规定最低出资额限制，只需申报人出资即可。一人有限公司的出资额不得低于注册成本的30%，而个人独资企业对出资未做出任何强制规定。
4. 税收缴纳规定不同：
一人有限责任公司需要缴纳企业所得税，个人独资企业不需要缴纳，需要缴纳个人所得税。国家法律规定从2000年1月起，个人独资企业和合作企业停止征收企业所得税，比照个体工商户生产经营征收个人所得税。
5. 投资者承担责任不同：
一人有限责任公司股东以认缴的出资额为限承担“有限责任”，个人独资企业的投资人以其个人资产对公司承担无限责任，投资人在申请企业设立登记证明时，确认以其家庭共有财产作为个人出资，依法以家庭共有财产对企业债务承担无限责任。
6. 财务核算要求不同
一人有限公司应当在每年年度终了时编制财务会计报告，并由会计事务所审计。个人独资企业则只需依法设置会计账簿来进行会计核算，无需经会计事务所审计。
